行政院組織改造法案業於28日經立法院三讀通過，科技部正式啟動組織調整，轉型為「國家科學及技術委員會」，組織定位如同國家發展委員會，將以國家整體科技發展的高度，政策協調台灣數位發展與產業創新，攜手數位發展部、經濟部、衛福部、農委會、文化部等，以跨部會、跨產學研之型態，引領台灣軟體、硬體整合創新。
科技部吳政忠部長表示，科技發展的能量，已不僅是國家目前與未來競爭力的指標，也是回應國內外社會挑戰與國家安全的關鍵。舉凡氣候變遷、災害防救、醫療生技及科研人才政策等，都是我國生存發展必須積極面對並解決的重要課題；「國家科學及技術委員會」將肩負串接整合各部會的科技政策與資源、完善科技政策的執行與管理，以及累積技術與人才的責任，希冀與各部會及產學研各界攜手精進，引領國家未來科技發展。
轉型後的國家科學及技術委員會(以下簡稱新國科會)，未來推動的重點工作與效益如下：
一、有別於舊國科會著重上游端之能量建置，新國科會將連接上、中、下游的技術發展與產業應用
「國家科學及技術委員會」的成立，將更有利深化基礎研究並連接上、中、下游的技術發展與產業應用，引領各部會進行科技前瞻研究，聚焦支援我國策略布局，推動社會創新，並合作制定推動人才的培育、延攬與留用政策，協力發展科研與產業創新生態圈。
二、有別於科技部於溝通協調上之侷限，新國科會以行政院高度，充分發揮跨域、跨部會協調功能，集中科技發展事務權責
為強化跨部會及跨領域等上、中、下游的溝通與連結，全方位地擘劃科技發展策略，「國家科學及技術委員會」將導入跨域參與機制、集結機關首長與各領域學者、專家，打造一個超越部會立場，具明確跨部會溝通協調功能與權責的組織，把科技政策之決策提升至行政院層級高度，補強我國科技研發的整合能力，以維持並提升我國國際競爭力。
三、新國科會將有效協助行政院通盤掌握各部會科技資源，妥善分配科技經費及優化使用效率
「國家科學及技術委員會」將增加對國家整體科學發展、技術研究及應用之規劃、協調、審議、資源分配及管理考核等職責，透過通盤掌握政府科技資源，進行預算審議與資源配置、政策規劃及執行之績效管考評估，以確保政策有效執行，優化科技經費使用效率與落實社會實質影響。
今日三讀通過之組織法案，仍待總統公布施行，惟科技部已加速整備法規、員額、預算等改制相關事宜，目前規劃明(111)年3月掛牌，並將儘速送請行政院核定。